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世界一片死寂。
厚重的铅云，笼罩着整个地球，地表的人类已然灭亡，但令人讽刺的是，上万枚核弹造成的核辐射与核冬天并没有像人类想象的那样灭绝丧尸。这些生命力极强的丧尸与极少部分动植物抗过了最初的爆炸与辐射，并在核冬天中最终活了下来，甚至因为辐射而产生了某种进化。
帝国远征军对此虽然感到有些意外，但并不在意，他们所在意的只有一样东西，那就是在核爆炸后地表之上如雨后春笋般到处冒出的巨大蓝色晶体。当然，这些在这个世界上从不曾出现过的东西并非核爆的产物，而是原本以某种诡异的形态潜藏于地球本身，直到帝国远征军借助核爆的力量以另一种超前的科技将其显露了出来。这些巨大的晶体，正是帝国远征军提到的新型矿产，但除了他们，无论真实国际还是安布雷都不知道这些所谓的新型矿产究竟有何作用。
真实国际按照协议为帝国远征军提供人类，由后者进行武装输送至地表进行矿产开采。随着晶体矿的不断开采，帝国远征军的力量开始出现质变，一种种此前人类从不曾想象过的先进科技飞速现世。
在核冬天中存活下来的丧尸们尽管对于帝国远征军毫无意义，但在李.琼斯的眼中，却是至宝。这些丧尸，不但在极大的基数下产生了足够的变异试验体，而且在持久的核辐射中令体内的g病毒产生了意想不到的进化，安布雷据此研究出了更强并部分可控的新型病毒，他们命之为t病毒。
所有地底幸存的人类将虚拟世界当成了必须的工作之外唯一的消遣，每时每刻都有无数人类沉溺期间，张远的计划大大加速，各种各样的试验体进入其中，虚拟世界也隐隐出现了质的变化。
新的世界，已经形成。